Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms