Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms