Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms