Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA4P35212 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms