Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL9P32969 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL9P32969 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL9P32969 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL9P32969 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms