Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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CASQ1P31415 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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CASQ1P31415 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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CASQ1P31415 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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CASQ1P31415 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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CASQ1P31415 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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CASQ1P31415 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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