Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms