Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms