Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms