Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms