Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF1P10914 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF1P10914 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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