Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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