Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRCP08575 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRCP08575 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRCP08575 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRCP08575 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRCP08575 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRCP08575 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PTPRCP08575 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PTPRCP08575 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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