Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBSP08397 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBSP08397 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms