Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPLO60437 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPLO60437 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPLO60437 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPLO60437 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms