Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms