Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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