Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms