Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms