Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCCD1A6NED2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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