Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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