Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATPIF1Q9UII2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms