Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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