Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GKN1Q9NS71 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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GKN1Q9NS71 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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