Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNPLA8Q9NP80 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms