Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms