Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms