Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms