Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms