Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms