Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms