Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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