Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHMTQ93088 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms