Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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FAM3CQ92520 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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FAM3CQ92520 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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FAM3CQ92520 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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FAM3CQ92520 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM3CQ92520 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3CQ92520 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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FAM3CQ92520 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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FAM3CQ92520 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3CQ92520 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3CQ92520 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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