Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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