Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms