Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms