Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ATG4DQ86TL0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ATG4DQ86TL0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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