Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms