Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms