Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNS3Q68CZ2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms