Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms