Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UVSSAQ2YD98 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms