Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms