Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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COL24A1Q17RW2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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