Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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