Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms