Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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