Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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