Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms